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BaseSpace CLI全名為BaseSpace Command Line Interface 最近Basespace多了指令API 許多生物資訊的自動化都可以在雲平台實現了 動機 Basespace的數據儀表板是實驗人員檢查數據品質的最佳利器，因此許多數據都會接回Bas...

生物資訊界已經廣泛使用vcf格式作為紀錄DNA變異的格式 這個格式包含SNV/indel/SV/CNV 而最近遇到一個資料轉換的問題跟大家分享解法 動機: 三級分析例如GWAS，起始資料格式是vcf格式 然而illumina SNP array的變異檔案格式是gtc...

Five Ways That a LIMS Accelerates NGS Research 在實驗室流程中 a)取得檢體的數據與資訊； b)輸入檢體數據與檢測結果； c)更改數據或檢測結果； d)授權釋出檢測結果單。 都是NGS實驗室內重要的流程 序列資訊離開實驗室前，...

LoopSeq Clone/Isolate Sequencing 在進行基因變異/蛋白轉譯工程時，你是否曾面對數以百計的clone需要序列鑑定而感到心煩意亂。面臨大量的序列需要鑑定時，你有更好的選擇，使用LoopSeq長片段定序試劑建庫，搭配illumina次世代定序高通量...

TGex是一套十分有用的變異評估平台 在一些臨床遺傳學知識充足的疾病上，可以解答接近6成的WES數據 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31888639/ 六月底剛完成更新，一起來看看它帶來甚麼令人驚艷的感受 完整更新資訊:...

Human genome project 20年了 Human genome上SNV,Indel變異的研究最多 讓我們來看看illumina 提供甚麼方案進行研究 Basespace上SNV app家族 illumna basespace有各式各樣分析工具...