Five Ways That a LIMS Accelerates NGS Research
在實驗室流程中 a)取得檢體的數據與資訊； b)輸入檢體數據與檢測結果； c)更改數據或檢測結果； d)授權釋出檢測結果單。
都是NGS實驗室內重要的流程 序列資訊離開實驗室前， 我們需要確認這之中檢體得到可信賴處理及產生的訊息被正確紀錄
因此LIMS變成實驗室要規模化或者協助合規的工具
下面提供五個實際上LIMS可以為基因體實驗室帶來的好處
1. 讓實驗室保持最前緣技術狀態 新技術跟新設備讓基因體數據通量不斷增加 傳統實驗室的實驗室管理大量依賴紙本/表單跟email 這限制實驗室的成長的規模 因為許多時間及成本都在不斷地確認下列問題 a. 分析的品項及研究目的 b. 物種及檢體來源 c. 數據如何產生 d. 設備的設定參數 e. 實驗的threshold數值 舊的方式缺乏效率，不適合流程複雜及品項複雜的基因體實驗室 LIMS可以簡化實驗記錄，放大實驗規模
2. 加速建立新設實驗流程及放大產出
藉由LIMS軟體建立Best Practice流程
並且追縱新設實驗產出及可回朔的數據
讓實驗人員不再用令人困惑Email或Excel表單追蹤進度
LIMS介面可以呈現有用的數據在同個頁面
讓實驗人員及時追蹤實驗進度並且以優質的效率執行實驗
3. 藉由樣本追蹤來優化結果
當執行高通量樣本建庫時，我們在意檢體的去向
詳實的樣品溯源紀錄包含從檢體接收到樣品下機紀錄
我們可以參考這些紀錄來優化實驗結果
同時上有些機構十分看重樣品的追蹤紀錄
因為這些紀錄對珍貴檢體尤其重要
4. 優化流程來增加實驗室效率
實驗室人員 設備 耗材 專案管理很複雜
一個忙碌實驗室常常不厭其煩地確認細節
LIMS可以設計規則來確認細節
如此一來可以簡化每日工作
5. 更快速的實驗紀錄輸出
LIMS可以整合數據品質及實驗記錄分析
協助稽核人員取得長期實驗紀錄及總結報告
illumina Clarity LIMS
illumina LIMS藉由長時間服務客戶經驗
規劃出最符合使用者體驗的NGS Lab的LIMS系統
包含樣本追蹤 流程管理 紀錄報告工具等等
其優勢包含但不限於
* 降低成本
* 應付持續NGS實驗變化
* 提高產量 維持品質
* 藉由簡化流程使研究人員專注實驗
* 協助合規
參考資料
* https://www.illumina.com.cn/content/illumina-marketing/spac/en_AU/products/by-type/informatics-products/basespace-clarity-lims.html
* https://reurl.cc/Mvp00L
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