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次世代定序相關試劑
APPLICATION
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Covid19
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Covid-19 Detection

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RNA

COVIDSeq Test (RUO Version)
COVIDSeq Assay (RUO Version)

  1. 設計Amplicons針對SARS-CoV-2病毒之RNA定序，並可從中發現受試者樣本之型態與變異點位

  2. 適用於鼻咽部棉棒採集樣本、口咽部棉棒採集樣本或是鼻腔棉棒採集樣本

  3. 需搭配Zymo Quick-DNA/RNA Viral MagBead 或是QIAGEN QIAamp Viral RNA Mini Kit 抽取樣本RNA

  4. COVIDSeq Test (RUO)最多可同時定序3072的樣本 (含控制組樣本)。

  5. 每個樣本需要1 M reads，因此在Nextseq 550 HighOutput試劑 或 NextSeq 2000 P2 試劑上每次可定序384個樣本；而在NovaSeq 6000使用 SP Xp Workflow單次可定序768個樣本 (384x2 lanes)，若以S4 Xp Workflow上機兩片最多可達3072個樣本 (384x4 lanes x2 FCs)

  6. COVIDSeq Assay (RUO)最多可製備96個樣本 (控制組需額外購買)。適用在低通量的桌上型定序儀使用，如：MiSeq、MiniSeq或 iSeq。

  7. ​可使用Dragen Bio-IT Server, 或是使用BaseSpace進行二級分析；可選擇僅偵測受試者感染狀態或是進行病毒株演化支研究分析

Oncology
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Oncology

腫瘤醫學

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DNA

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RNA

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ctDNA

TruSight Oncology 500 (TSO 500)

  1. 設計大小1.94 Mb，涵蓋有523 個與癌症相關之DNA與RNA 基因

  2. 適用於FFPE樣本或是ctDNA樣本

  3. 一次性檢測多種癌症的多種基因變化：SNV, CNV, indel, Splicing site，以MSI及TMB獲得全面性的基因圖譜；也可偵測RNA Fusion

  4. FFPE樣本推薦使用Nextseq 550 /2000定序；另高通量實驗室者可選用NovaSeq 6000定序

  5. ctDNA樣本推薦使用NovaSeq 6000定序

  6. ​可使用Server 搭載的Docker, Dragen Bio-IT Server, 機台自帶之Local Run Manager或是使用PierianDx Clinical Genomics Workspace (CGW)進行分析

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DNA

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RNA

TruSight Tumor 170 (TST170)

  1. 整合DNA&RNA標靶與癌症相關的170個基因

  2. ​可偵測DNA的 SNV, indel 變異；RNA可偵測Fusion變異

  3. 推薦使用NextSeq 550 / 1000 / 2000機台定序

  4. 可使用BaseSpace進行二級分析

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DNA

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RNA

AmpliSeq for Illumina Focus Panel

  1. 腫瘤相關的52個DNA與RNA基因

  2. ​可偵測DNA的 SNV, indel 變異；RNA可偵測Fusion變異

  3. 推薦使用iSeq, miniSeq, miSeq機台定序

  4. 可使用機台自帶之Local Run Manager進行二級分析；或是使用BaseSpace進行二級分析

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DNA

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RNA

AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3

  1. 腫瘤相關的161個DNA與RNA基因

  2. 可偵測DNA的 SNV, indel 變異；RNA可偵測Fusion變異

  3. 推薦使用NextSeq 550 / 1000 / 2000 機台定序

  4. 可使用機台自帶之Local Run Manager進行二級分析；或是使用BaseSpace進行二級分析

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DNA

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RNA

AmpliSeq for Illumina Childhood Cancer Panel

  1. 孩童腫瘤相關的203個基因

  2. 推薦使用iSeq, miniSeq, miSeq機台定序

  3. 可使用機台自帶之Local Run Manager進行二級分析；或是使用BaseSpace進行二級分析

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DNA

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RNA

AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel

  1. 包含髓性血液惡性腫瘤相關40個基因，29個RNA融合基因和5個基因表現量

  2. 適用於血液或是骨髓樣本

  3. ​可偵測SNV, indel, Fusion, Somatic Variants

  4. 推薦使用 miniSeq, miSeq機台定序

  5. 可使用機台自帶之Local Run Manager進行二級分析；或是使用BaseSpace進行二級分析

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FFPE

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DNA

AmpliSeq for Illumina BRCA Panel

  1. 包含有BRCA1/2 基因

  2. 可探究Somatic 或是 Germline 突變，包含SNV, indel 的分析

  3. 推薦使用iSeq, miniSeq, miSeq機台定序

  4. 可使用機台自帶之Local Run Manager進行二級分析；或是使用BaseSpace進行二級分析

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FFPE

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DNA

AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2

  1. 覆蓋50個腫瘤相關基因來自 COSMIC資料庫約2800個熱點突變。

  2. 可偵測SNV, indel,  Somatic Variants

  3. 推薦使用 iSeq, miniSeq, miSeq機台定序

  4. 可使用機台自帶之Local Run Manager進行二級分析；或是使用BaseSpace進行二級分析

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FFPE

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DNA

AmpliSeq for Illumina Custom DNA Panel

  1. 針對目標區域設計12-2,000 amplicons的客製化panel

  2. 可選擇DNA或是RNA設計

  3. 可以選擇全基因區段設計或是Hot spot方式設計

  4. 可設計人類、小鼠、或是牛、豬、雞、狗、綿羊、玉米、黃豆、稻米、番茄之基因

  5. 另外有On-Demand 方式設計人類 Germline相關基因

illumina尚有種類多元的試劑晶片提供您不同領域的應用，歡迎您來電洽詢02-23253253 分機520，566，598

Metagenomics
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Genomic DNA /Saliva/Blood

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DNA

illumina DNA Prep

快速的流程，適合廣泛的應用，從人類全基因體定序到其他動物、植物、質體和各種微生物。

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Genomic DNA /Saliva/Blood/ FFPE

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DNA

illumina DNA Prep with Enrichment

快速的流程，適合於全血、唾液、Genomic DNA或是FFPE抽取之DNA樣本。搭配Enrichment試劑以Probes方式抓取目標基因，可應用於人類全外顯子定序、TruSight ONE等。

​另外也適用於第三方設計之Probes，例如：IDT或 Twist廠商

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Genomic DNA

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DNA

TruSeq DNA PCR-Free

適合廣泛的應用，從人類全基因體定序到其他動物、植物、質體和各種微生物。
需要使用較高量的DNA (1 ug)。
Library製備完成後沒有經過PCR放大過程，相對減少PCR Error Bias產生的資料分析錯誤
可依樣本數量選擇低通量或高通量試劑組。

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Genomic DNA

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DNA

TruSeq DNA Nano

適合廣泛的應用，從人類全基因體定序到其他動物、植物、質體和各種微生物。可依樣本數量選擇低通量或高通量試劑組。

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Genomic DNA

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DNA

Nextera XT DNA Library Preparation Kit

快速操作與建庫流程。適用於所有物種，人類、動物、植物、病毒細菌等等，手動操作時間小於15分鐘且整體文庫製備時間只需90分鐘。

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Genomic DNA/

RNA

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DNA

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RNA

AmpliSeq for Illumina Community Panels

​另有31種其他應用之Panels，包含有聽力損失、心血管疾病、自閉症、失智症、努南氏症、RNA發炎反應等研究。

RGH
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cfDNA

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DNA

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SERVER

VeriSeq NIPT

評估妊娠期胎兒之染色體套數變異。特別針對第13、18與21對染色體三倍體檢測。

​搭載專門的分析Server，定序完成後資料進入Server分析並生成結果。

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Microarray

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Blood

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DNA

本產品之基因設計有約70萬個 Markers，覆蓋約4800個基因。可用於檢測人類基因組上之結構性變異如：duplications, deletions, amplifications, copy-neutral loss of heterozygosity (LOH), 以及 mosaicism。

​適用於細胞遺傳學檢測，產前、產後或是癌症基因拷貝數分析。

可搭載BioDiscovery Nexus Clinical做後續資料分析與解釋

Global Screening Array Cyto (GSA-Cyto)
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Microarray

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Blood

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DNA

本產品之基因設計有約180萬個 Markers，覆蓋約4800個基因。可用於檢測人類基因組上之結構性變異如：duplications, deletions, amplifications, copy-neutral loss of heterozygosity (LOH), 以及 mosaicism。

​適用於細胞遺傳學檢測，產前、產後或是癌症基因拷貝數分析。

可搭載BioDiscovery Nexus Clinical做後續資料分析與解釋

Global Diversity Array Cyto (GDA-Cyto)
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Microarray

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Blood

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DNA

本產品之基因設計有約30萬個single nucleotide polymorphisms (SNPs) 位點。可用於檢測人類基因組上之結構性變異如：duplications, deletions, amplifications, copy-neutral loss of heterozygosity (LOH), 以及 mosaicism。

HumanCytoSNP-12 v2.1
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Microarray

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Blood

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DNA

本產品之基因設計參考於International Collaboration for Clinical Genomics (ICCG) and the Cancer Genomics Consortium (CGC)，包含有約85萬個single nucleotide polymorphisms (SNPs) 位點覆蓋於約3262個基因上。

Infinium CytoSNP-850K v1.2
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Microarray

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Blood & Embryo biopsy

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DNA

本產品設計包含約30萬個marks覆蓋於全基因上，可用於胚胎植入前基因診斷(Preimplantation genetic diagnosis, PGD)。

HumanKaryomap-12 DNA Analysis Kit

illumina尚有種類多元的試劑晶片提供您不同領域的應用，歡迎您來電洽詢02-23253253 分機520，566，598

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