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3個BSSH APP將由更完整的功能取代

前言

illumina Basesapce自從收費後,功能全面升級 讓使用者得到更好的功能,獲得更好的體驗 同時Basespace也是相當經濟的備份空間 關於更經濟的備份空間,我以後專門做文章給大家講解


近期更新

被影響的產品

  • ITS Metagenomics

  • Kraken Metagenomics

  • Pisces Variant Caller

可以取代的APP

  • 16S Metagenomics

  • 16S Metagenomics DataBase Creator

  • DRAGEN Metagenomics

  • DRAGEN Enrichment

其對應如下


差異

過去ITS metagenomics app只能僅限於舊版ITS UNITE真菌資料庫,分析內容有限,例如要藻礁生態系中的藻類就不在此列

現在用16s Metagenomics 可以自行加入16S+真菌ITS+真核生物ITS資料庫,尤其加入alpha diversity分析,讓你的微生物分析更加全面。


而近期Illumina發展二級分析基礎建設,藉由DRAGEN加速工具,既有的Metagenome Kraken及SNV indel分析可以轉移到新的DRAGEN平台上,可以分析更快更精準。

告訴大家一個好消息,DRAGEN Metagenome仍是免費



注: DRAGEN Kraken是藉由加速去除宿主DNA的一套流程,後續輸出依照Kraken流程結果,而DRAGEN Enrichment是加速Variant calling,輸出為VCF檔及BAM檔


結語

功能更多更方便的Basespace歡迎大家一起使用

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