前言
illumina Basesapce自從收費後，功能全面升級 讓使用者得到更好的功能，獲得更好的體驗 同時Basespace也是相當經濟的備份空間 關於更經濟的備份空間，我以後專門做文章給大家講解
近期更新
被影響的產品
ITS Metagenomics
Kraken Metagenomics
Pisces Variant Caller
可以取代的APP
16S Metagenomics
16S Metagenomics DataBase Creator
DRAGEN Metagenomics
DRAGEN Enrichment
其對應如下
差異
過去ITS metagenomics app只能僅限於舊版ITS UNITE真菌資料庫，分析內容有限，例如要藻礁生態系中的藻類就不在此列。
現在用16s Metagenomics 可以自行加入16S+真菌ITS+真核生物ITS資料庫，尤其加入alpha diversity分析，讓你的微生物分析更加全面。
而近期Illumina發展二級分析基礎建設，藉由DRAGEN加速工具，既有的Metagenome Kraken及SNV indel分析可以轉移到新的DRAGEN平台上，可以分析更快更精準。
告訴大家一個好消息，DRAGEN Metagenome仍是免費
注: DRAGEN Kraken是藉由加速去除宿主DNA的一套流程，後續輸出依照Kraken流程結果，而DRAGEN Enrichment是加速Variant calling，輸出為VCF檔及BAM檔
結語
功能更多更方便的Basespace歡迎大家一起使用
Comments